Цель эконологии – решение задач обеспечения сбалансированного (гармоничного) развития экономико-экологических систем в условиях интенсификации освоения природно-ресурсного потенциала.

В основе эконологической методологии: закономерности формирования и функционирования целостных экономико-экологических систем; законы экономико-экологических взаимодействий и отношений; принципы экономико-экологической оптимизации и методы планирования, оптимального управления и развития экономико-экологических систем и объектов; системный анализ; методы экономики, экологии и социологии; методы оптимизации; теория информации; теория игр; теория катастроф; эконометрия; методы моделирования и имитации экономико-экологических систем.